I 1995 tog det daværende Storstrøms Amt initiativ til nedsættelse af en idekomité vedrørende etablering af en fast forbindelse over Femern Bælt. Komiteen fik fhv. industriminister Nils Wilhjelm som formand. Komiteen lagde gennem 11 år et stort arbejde i at skabe en interesse omkring en fast forbindelse over Femern Bælt og var på dansk side det samlende forum.

I forbindelse med kommunalreformen blev amterne nedlagt, og som følge heraf besluttedes det at lægge det videre arbejde i forhold til Femern Bælt-projektet over i en ikke-erhvervsdrivende fond.  Fonden Femern Bælt Forum blev således stiftet i november 2006 af Storstrøms Amt.

I Fonden Femern Bælt Forum er ved udgangen af 2008 følgende interessenter repræsenteret: Region Sjælland, Lolland Kommune, Guldborgsund Kommune, Vordingborg Kommune, Næstved Kommune, Faxe Kommune, Stevns Kommune, Køge Kommune og Ringsted Kommune, samt LO og DI.

Fonden Femern Bælt Forum er i slutningen af 2008 blevet omstruktureret, således at fonden fra og med 2009 er en erhvervsdrivende fond med navnet Fonden Femern Belt Development. Fondens bestyrelse udgøres af 9 personer, og derudover af et Forum, hvor alle interessenter er repræsenteret.

Fremover vil fonden være et ”udviklingsselskab”, der fungerer som ”one-door” for kommuner, erhvervsliv, jobcentre/Beskæftigelsesregionen, uddannelsesinstitutioner m.fl. i forhold til formidling af viden og information om Femern Bælt projektet og de udviklingsaktiviteter, der knytter sig til eller udspringer af projektet.